En algún que otro caso puede ser interesante estabilizar sólo partes concretas de una escena y no el clip completo. Para ello se divide el clip en la línea de tiempo del programa de edición de vídeo:
| zona intacta | zona que se ha de estabilizar | zona intacta |
La zona que se ha de estabilizar se procesa con el plugin de Mercalli. Al final de cuentas este procedimiento ahorra tiempo de cálculo.